Die Behandlung wird meistens ambulant (in der Praxis) durchgeführt. Die "klassische Thymus-Kur" besteht aus 10 bis 15 Spritzen, die in einem Zeitraum von 2 bis 5 Wochen verabreicht werden. Die Anwendung erfolgt in den Gesäßmuskel und ist praktisch schmerzlos. Je nach Krankheitsbild kann dieses Therapieschema verändert werden. Bei manchen chronischen Erkrankungen kann die Therapie durch zusätzliche Injektionen (1 bis 2 Mal pro Woche über 2 bis 3 Monate) noch verbessert werden.